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Plate-formes techniques
 Génomique environnementale : Génotypage-Séquençage à la SFR MEB
Domaine : Plateformes de l'IFR MEB
Contact : Erick Desmarais
Tél : 0467144689
E-mail : erick.desmarais@univ-montp2.fr

Description

Lieu : Université Montpellier 2, Campus du Triolet, Place Eugène Bataillon, Bâtiment 24, 1er étage

Description : Ce plateau technique a pour mission de doter l’ensemble de la communauté scientifique des technologies de génotypage-séquençage par électrophorèse capillaire à moyen débit et de gestion automatisée des flux d’échantillons. L’expertise mise en œuvre est plus particulièrement tournée vers les analyses de la Biodiversité naturelle mais l’ouverture est totale, dans la mesure des moyens disponibles, pour tout projet faisant appel aux technologies disponibles.
Il met à la disposition des utilisateurs les moyens nécessaires à l’obtention d'analyses de qualité: infrastructure, informatique et maintenance. Plus particulièrement, le personnel de la plateforme assure le fonctionnement et l’entretien périodique des appareils.
Ce plateau est en contact étroit avec l'ensemble du réseau d'analyses moléculaires des laboratoires d'agronomie et de biologie-santé du site montpelliérain avec lesquels les échanges et la concertation sont constants.

Contacts: Erick Desmarais (desmarais@univ-montp2.fr ), Philippe Gauthier (pgauthier@supagro.inra.fr )

►Autre personnel: Frédérique Cerqueira (AI CNRS)

Activité 2011 :
   
216484 échantillons analysés dont 189872 génotypages, 26612 séquences

Activité depuis 2006:

 

Répartition mensuelle de l’activité depuis 2008:


Equipement disponible

Trois séquenceurs Applied ABI Prism 3130 XL 16 capillaires
Un pipetteur automatique Beckman Biomek 3000
Un spectromètre Nanodrop ND8000 (8 capillaires)
Logiciels: GeneMapper et SeqScape Software