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Plate-formes techniques
 Analyses chimiques en Ecologie
Domaine : Plateformes de l'IFR MEB
Contact : Bruno Buatois
 
E-mail : bruno.buatois@cefe.cnrs.fr

Description

►Lieu : CEFE, Campus CNRS, 1919 Route de Mende, Montpellier

►Description : Les objectifs de la plateforme sont de (1) mettre à disposition des scientifiques des équipements d'analyse chimique et le savoir faire correspondant, (2) organiser une gestion professionnelle rapprochée des équipements, et (3) aider à la mise en place de nouvelles méthodes d'analyse. La recherche en écologie nécessite des techniques d’analyses pour déterminer la qualité et la quantité des éléments et des molécules jouant un rôle dans les processus fonctionnels et interactifs. Les techniques et les appareillages en service au CEFE sont regroupés en 4 grands pôles :

Ecologie chimique : Séparation, identification de composés non-structurels ayant un rôle dans la physiologie ou la communication, par chromatographie et spectrométrie de masse et tests comportementaux,
Ecologie des sols : étude de leurs compositions (C, N, P, NH4+, NO3-, NO2-, matière minérale) et de leurs fonctionnements et diversité biologiques : dénitrification, nitrification, respiration, dénombrement bactériens, profils métaboliques des communautés microbiennes…
Analyses de spectrométrie infrarouge : utilisation des méthodes NIRS et FT-IR pour prédire la composition d’échantillons végétaux frais et en décomposition, de sols …
Analyses de routine : elles permettent le dosage dans les végétaux des constituants suivants : C, N, P, Zn, fibres (cellulose, hémicellulose lignine), lipides et sucres totaux, composés phénoliques totaux, matière minérale, dosage immunologiques…

►Contacts : Responsable technique: Bruno Buatois <bruno.buatois@cefe.cnrs.fr>
                    Responsable scientifique: C. Roumet <catherine.roumet@cefe.cnrs.fr>

►Quelques chiffres clés :
      • En moyenne (par an) : 60 utilisateurs dont 20 personnes extérieures au CEFE; 20 000 analyses
      • 468k€ investi en 6 ans (02-07) pour des équipements et des réfections de laboratoires
      • En 2008, achat d’un GC-MS quadripôle mutualisé (20k€ de l’IFR119)

►Fonctionnement : Les membres du service ne sont pas chargés d’effectuer les analyses de routine. Après contact avec les responsables, l’utilisation du service se déroule suivant les étapes :
- inscription et présentation aux responsables,
- évaluation du travail et établissement d’un protocole (dépendant du type et du nb. d’analyses, calcul du coût et du temps nécessaire),
- formation aux techniques, appareillages et aux règles d’hygiène et de sécurité,
- validation des résultats et retour d’expérience.
 


Equipement disponible

Quelques équipements :

2 Chromatographes couplés à des Spectromètres de masse,
2 Chromatographes à détection de flamme dont un couplé à un électro-anténnographe,
2 Chromatographes équipés de détecteur ECD et Catharométriques,
2 spectromètres NIR et un spectromètre MIR,
1 analyseur élémentaire…

1 Chromatographe en phase gazeuse – spectromètre de masse QP2010 plus SHIMADZU

Cet ensemble, composé d’un chromatographe en phase gazeuse et d’un spectromètre de masse, est équipé d’un passeur automatique d’échantillons liquides à 100 positions, de 2 injecteurs (dont 1 PTV). Ces injecteurs permettent l’introduction simultanée des échantillons dans 2 colonnes dont l’une est reliée à un détecteur FID utilisé pour la quantification des composés organiques volatiles. La seconde colonne est reliée au spectromètre de masse « quadripôlaire » qui permet la détection de composés ionisés soit en impact électronique soit en ionisation chimique. La comparaison des spectres de masse obtenus avec ceux de différentes banques permet d’identifier les composés.